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El diagnóstico clínico está basado en la detección de vesículas que muy pronto se rompen, dejando zonas desprovistas de tejidos sangrantes muy dolorosas en: boca (lengua, carrillos, rodete dentario y encías), morro, espacio entre los dedos y surco coronario (raíz de la pezuña) en las patas y en los pezones (ubre).

Pirexia o fiebre de 41°C o más, que declina abruptamente al segundo día, simultáneamente se inicia la formación de vesículas o ampollas.

Se presenta una drástica disminución de la producción de leche en vacas que están en ordeño, que generalmente es seguida de la aparición de mastitis (inflamación de la ubre), que posteriormente, si el animal logra recuperarse pierde totalmente la capacidad de producir leche; y en el caso de animales destinados a la producción de carne, los que sobrevivan, nunca lograrán recobrar el peso ni desarrollar todo el potencial de producción.

Se produce una abundante salivación o babeo y descargas (secreciones) nasales desde serosas (líquidas) a mucopurulentas (con moco espeso) a medida que progresa la enfermedad, como consecuencia de la formación y ruptura de las vesículas que por lo general sufren una contaminación bacteriana, dificultando grandemente la ingestión de alimentos, estableciéndose focos infecciosos secundarios que complican todo el cuadro clínico.

Además de las vesículas en la boca, las lesiones en los espacios interdigitales, en el rodete coronario (raíz de la pezuña) y en los dedos accesorios causan una cojera aguda que inmoviliza al animal por el intenso dolor que le produce y la infección que también se establece, como producto de la contaminación bacteriana secundaria.

Las hembras preñadas generalmente abortan, más como producto de la fiebre que se presenta que por la acción del virus.

La mortalidad es alta en animales jóvenes debido a la acción del virus sobre el corazón que determina la presentación de una miocarditis hiperaguda (inflamación muy aguda del músculo del corazón) que produce la muerte de terneros y animales jóvenes en general, sin que se lleguen a presentar los otros signos clínicos, como vesículas, cojera, etc. En otras palabras, aunque la infección le haya dado al mismo tiempo a jóvenes y adultos, los primeros mueren antes que los adultos presenten los síntomas de la enfermedad. En la necropsia (examen del cadáver), los animales jóvenes, muestran el llamado “corazón atigrado”, por la apariencia que presenta